Игра Mortal Kombat 4 первая в серии MK, полностью сделанная в трёхмерной графике. В целом при переноси в 3D игра сохранила каноны серии. Самой заметной новой особенностью в игровом процессе стало возможность использовать оружие и некоторые предметы на уровнях.

Разработчики во главе с Эдом Буном, делая новую игру МК, поставили перед собой революционно-консервативную цель - перейти в третье измерение c сохранением ощущения "двухмерности" игрового процесса. В то время, как в других 3D-файтингах ставка делалась на реалистичность движений, МК4 должен был "взять своё" высокой динамичностью и скоростью, присущими успешной третьей части. Для новой игры был специально разработан 3D-движок, который сначала был опробован на похожем по стилю, но оказавшемся провальным файтинге War Gods.